Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP2AP05549 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFAP2AP05549 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFAP2AP05549 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TFAP2AP05549 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFAP2AP05549 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFAP2AP05549 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP2AP05549 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP2AP05549 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFAP2AP05549 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFAP2AP05549 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFAP2AP05549 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP2AP05549 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP2AP05549 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAP2AP05549 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAP2AP05549 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP2AP05549 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP2AP05549 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP2AP05549 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFAP2AP05549 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP2AP05549 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP2AP05549 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAP2AP05549 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TFAP2AP05549 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TFAP2AP05549 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP2AP05549 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TFAP2AP05549 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFAP2AP05549 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFAP2AP05549 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TFAP2AP05549 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP2AP05549 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TFAP2AP05549 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFAP2AP05549 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP2AP05549 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAP2AP05549 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP2AP05549 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP2AP05549 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP2AP05549 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP2AP05549 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP2AP05549 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAP2AP05549 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAP2AP05549 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAP2AP05549 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAP2AP05549 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAP2AP05549 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFAP2AP05549 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP2AP05549 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFAP2AP05549 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFAP2AP05549 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAP2AP05549 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAP2AP05549 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFAP2AP05549 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP2AP05549 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP2AP05549 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFAP2AP05549 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFAP2AP05549 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TFAP2AP05549 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TFAP2AP05549 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFAP2AP05549 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFAP2AP05549 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TFAP2AP05549 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAP2AP05549 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAP2AP05549 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAP2AP05549 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAP2AP05549 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAP2AP05549 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAP2AP05549 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP2AP05549 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAP2AP05549 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP2AP05549 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAP2AP05549 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP2AP05549 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFAP2AP05549 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFAP2AP05549 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP2AP05549 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP2AP05549 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP2AP05549 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP2AP05549 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP2AP05549 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP2AP05549 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP2AP05549 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms