Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNA4P05014 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA4P05014 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNA4P05014 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNA4P05014 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA4P05014 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNA4P05014 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA4P05014 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFNA4P05014 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA4P05014 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA4P05014 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFNA4P05014 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA4P05014 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA4P05014 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFNA4P05014 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFNA4P05014 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA4P05014 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNA4P05014 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA4P05014 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA4P05014 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA4P05014 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA4P05014 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA4P05014 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA4P05014 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNA4P05014 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA4P05014 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA4P05014 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA4P05014 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNA4P05014 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNA4P05014 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNA4P05014 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNA4P05014 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNA4P05014 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNA4P05014 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA4P05014 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA4P05014 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNA4P05014 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA4P05014 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA4P05014 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA4P05014 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNA4P05014 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNA4P05014 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA4P05014 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNA4P05014 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNA4P05014 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA4P05014 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNA4P05014 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA4P05014 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNA4P05014 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA4P05014 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA4P05014 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA4P05014 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA4P05014 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA4P05014 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA4P05014 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA4P05014 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA4P05014 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA4P05014 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms