Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFNA4P05014 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNA4P05014 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNA4P05014 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFNA4P05014 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNA4P05014 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNA4P05014 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNA4P05014 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNA4P05014 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFNA4P05014 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNA4P05014 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNA4P05014 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNA4P05014 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNA4P05014 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNA4P05014 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNA4P05014 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNA4P05014 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNA4P05014 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNA4P05014 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFNA4P05014 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNA4P05014 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFNA4P05014 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNA4P05014 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNA4P05014 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNA4P05014 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNA4P05014 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNA4P05014 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNA4P05014 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNA4P05014 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNA4P05014 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNA4P05014 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFNA4P05014 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNA4P05014 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNA4P05014 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNA4P05014 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNA4P05014 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNA4P05014 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNA4P05014 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNA4P05014 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNA4P05014 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA4P05014 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNA4P05014 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA4P05014 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA4P05014 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNA4P05014 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA4P05014 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNA4P05014 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNA4P05014 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNA4P05014 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNA4P05014 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNA4P05014 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNA4P05014 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNA4P05014 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNA4P05014 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFNA4P05014 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNA4P05014 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA4P05014 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNA4P05014 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA4P05014 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA4P05014 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNA4P05014 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNA4P05014 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA4P05014 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA4P05014 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNA4P05014 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNA4P05014 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNA4P05014 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNA4P05014 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNA4P05014 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNA4P05014 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNA4P05014 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA4P05014 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA4P05014 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFNA4P05014 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA4P05014 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA4P05014 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNA4P05014 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNA4P05014 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFNA4P05014 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNA4P05014 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNA4P05014 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA4P05014 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNA4P05014 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNA4P05014 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms