Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC3P02656 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC3P02656 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC3P02656 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC3P02656 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC3P02656 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC3P02656 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC3P02656 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC3P02656 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOC3P02656 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC3P02656 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOC3P02656 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC3P02656 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC3P02656 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC3P02656 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC3P02656 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC3P02656 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC3P02656 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC3P02656 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC3P02656 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC3P02656 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC3P02656 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOC3P02656 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOC3P02656 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC3P02656 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC3P02656 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC3P02656 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC3P02656 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC3P02656 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC3P02656 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOC3P02656 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC3P02656 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC3P02656 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOC3P02656 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC3P02656 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC3P02656 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC3P02656 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC3P02656 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC3P02656 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC3P02656 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC3P02656 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC3P02656 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC3P02656 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC3P02656 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC3P02656 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC3P02656 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC3P02656 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC3P02656 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC3P02656 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC3P02656 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC3P02656 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC3P02656 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC3P02656 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC3P02656 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC3P02656 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC3P02656 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC3P02656 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC3P02656 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC3P02656 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC3P02656 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC3P02656 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC3P02656 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC3P02656 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC3P02656 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC3P02656 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC3P02656 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC3P02656 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC3P02656 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC3P02656 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC3P02656 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC3P02656 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOC3P02656 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOC3P02656 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC3P02656 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOC3P02656 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOC3P02656 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC3P02656 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOC3P02656 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC3P02656 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOC3P02656 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOC3P02656 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC3P02656 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOC3P02656 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOC3P02656 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOC3P02656 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC3P02656 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOC3P02656 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC3P02656 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOC3P02656 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOC3P02656 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOC3P02656 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC3P02656 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOC3P02656 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOC3P02656 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC3P02656 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC3P02656 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC3P02656 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC3P02656 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOC3P02656 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOC3P02656 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms