Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNA17P01571 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNA17P01571 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFNA17P01571 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFNA17P01571 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFNA17P01571 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA17P01571 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFNA17P01571 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFNA17P01571 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA17P01571 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFNA17P01571 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA17P01571 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA17P01571 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA17P01571 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA17P01571 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA17P01571 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA17P01571 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNA17P01571 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNA17P01571 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA17P01571 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA17P01571 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA17P01571 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA17P01571 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA17P01571 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA17P01571 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA17P01571 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNA17P01571 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNA17P01571 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNA17P01571 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNA17P01571 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNA17P01571 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA17P01571 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA17P01571 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNA17P01571 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNA17P01571 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNA17P01571 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA17P01571 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNA17P01571 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNA17P01571 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNA17P01571 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA17P01571 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA17P01571 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA17P01571 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNA17P01571 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNA17P01571 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNA17P01571 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA17P01571 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA17P01571 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA17P01571 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA17P01571 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNA17P01571 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNA17P01571 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA17P01571 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA17P01571 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA17P01571 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA17P01571 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNA17P01571 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA17P01571 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA17P01571 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNA17P01571 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNA17P01571 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNA17P01571 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA17P01571 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA17P01571 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA17P01571 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA17P01571 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA17P01571 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA17P01571 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA17P01571 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA17P01571 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA17P01571 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA17P01571 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFNA17P01571 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA17P01571 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA17P01571 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA17P01571 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA17P01571 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms