Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA1P01562 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA1P01562 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNA1P01562 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA1P01562 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNA1P01562 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNA1P01562 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA1P01562 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA1P01562 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA1P01562 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFNA1P01562 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA1P01562 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA1P01562 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA1P01562 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA1P01562 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNA1P01562 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA1P01562 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA1P01562 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA1P01562 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA1P01562 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA1P01562 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA1P01562 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA1P01562 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA1P01562 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA1P01562 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA1P01562 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA1P01562 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNA1P01562 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA1P01562 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA1P01562 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA1P01562 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA1P01562 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNA1P01562 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA1P01562 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA1P01562 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA1P01562 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA1P01562 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA1P01562 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA1P01562 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA1P01562 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA1P01562 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNA1P01562 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNA1P01562 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA1P01562 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA1P01562 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNA1P01562 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA1P01562 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNA1P01562 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNA1P01562 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA1P01562 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNA1P01562 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNA1P01562 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNA1P01562 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNA1P01562 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA1P01562 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA1P01562 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNA1P01562 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNA1P01562 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNA1P01562 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA1P01562 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA1P01562 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA1P01562 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms