Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSPAN12O95859 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSPAN12O95859 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSPAN12O95859 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSPAN12O95859 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSPAN12O95859 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSPAN12O95859 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSPAN12O95859 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TSPAN12O95859 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSPAN12O95859 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSPAN12O95859 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSPAN12O95859 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSPAN12O95859 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSPAN12O95859 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSPAN12O95859 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSPAN12O95859 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSPAN12O95859 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSPAN12O95859 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSPAN12O95859 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSPAN12O95859 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSPAN12O95859 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSPAN12O95859 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TSPAN12O95859 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSPAN12O95859 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSPAN12O95859 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSPAN12O95859 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSPAN12O95859 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSPAN12O95859 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSPAN12O95859 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSPAN12O95859 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN12O95859 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN12O95859 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSPAN12O95859 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSPAN12O95859 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN12O95859 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN12O95859 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSPAN12O95859 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN12O95859 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN12O95859 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN12O95859 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN12O95859 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSPAN12O95859 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN12O95859 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN12O95859 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN12O95859 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN12O95859 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN12O95859 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN12O95859 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN12O95859 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSPAN12O95859 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN12O95859 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN12O95859 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN12O95859 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN12O95859 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN12O95859 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN12O95859 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TSPAN12O95859 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TSPAN12O95859 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN12O95859 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN12O95859 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN12O95859 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN12O95859 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN12O95859 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN12O95859 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN12O95859 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN12O95859 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN12O95859 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN12O95859 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN12O95859 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN12O95859 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN12O95859 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN12O95859 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN12O95859 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN12O95859 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN12O95859 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSPAN12O95859 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms