Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSNA1O43805 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSNA1O43805 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSNA1O43805 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSNA1O43805 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSNA1O43805 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSNA1O43805 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSNA1O43805 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSNA1O43805 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSNA1O43805 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSNA1O43805 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSNA1O43805 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSNA1O43805 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSNA1O43805 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSNA1O43805 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSNA1O43805 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSNA1O43805 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSNA1O43805 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSNA1O43805 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSNA1O43805 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSNA1O43805 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSNA1O43805 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSNA1O43805 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSNA1O43805 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSNA1O43805 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSNA1O43805 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSNA1O43805 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSNA1O43805 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSNA1O43805 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSNA1O43805 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSNA1O43805 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSNA1O43805 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSNA1O43805 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSNA1O43805 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSNA1O43805 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSNA1O43805 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSNA1O43805 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSNA1O43805 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSNA1O43805 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSNA1O43805 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSNA1O43805 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSNA1O43805 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSNA1O43805 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSNA1O43805 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSNA1O43805 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSNA1O43805 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSNA1O43805 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSNA1O43805 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSNA1O43805 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSNA1O43805 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSNA1O43805 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSNA1O43805 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSNA1O43805 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSNA1O43805 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSNA1O43805 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSNA1O43805 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSNA1O43805 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSNA1O43805 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSNA1O43805 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSNA1O43805 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSNA1O43805 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSNA1O43805 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSNA1O43805 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSNA1O43805 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSNA1O43805 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSNA1O43805 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms