Protein–RNA interactions for Protein: O43396

TXNL1, Thioredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1O43396 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNL1O43396 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TXNL1O43396 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TXNL1O43396 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TXNL1O43396 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNL1O43396 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNL1O43396 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNL1O43396 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNL1O43396 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNL1O43396 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNL1O43396 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNL1O43396 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNL1O43396 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNL1O43396 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TXNL1O43396 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNL1O43396 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNL1O43396 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNL1O43396 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNL1O43396 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNL1O43396 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNL1O43396 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNL1O43396 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNL1O43396 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNL1O43396 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNL1O43396 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNL1O43396 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNL1O43396 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNL1O43396 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNL1O43396 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TXNL1O43396 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TXNL1O43396 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TXNL1O43396 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNL1O43396 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TXNL1O43396 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNL1O43396 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNL1O43396 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNL1O43396 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNL1O43396 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNL1O43396 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNL1O43396 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNL1O43396 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNL1O43396 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNL1O43396 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNL1O43396 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNL1O43396 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNL1O43396 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNL1O43396 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNL1O43396 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNL1O43396 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNL1O43396 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TXNL1O43396 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms