Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARPC5O15511 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARPC5O15511 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARPC5O15511 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARPC5O15511 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARPC5O15511 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARPC5O15511 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARPC5O15511 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARPC5O15511 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARPC5O15511 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARPC5O15511 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARPC5O15511 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARPC5O15511 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARPC5O15511 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARPC5O15511 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARPC5O15511 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARPC5O15511 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARPC5O15511 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARPC5O15511 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARPC5O15511 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARPC5O15511 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARPC5O15511 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARPC5O15511 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARPC5O15511 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARPC5O15511 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARPC5O15511 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARPC5O15511 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARPC5O15511 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARPC5O15511 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARPC5O15511 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARPC5O15511 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARPC5O15511 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARPC5O15511 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARPC5O15511 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARPC5O15511 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARPC5O15511 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARPC5O15511 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARPC5O15511 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARPC5O15511 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARPC5O15511 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARPC5O15511 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARPC5O15511 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARPC5O15511 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARPC5O15511 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARPC5O15511 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARPC5O15511 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARPC5O15511 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARPC5O15511 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARPC5O15511 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC5O15511 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC5O15511 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC5O15511 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARPC5O15511 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARPC5O15511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARPC5O15511 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARPC5O15511 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC5O15511 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC5O15511 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARPC5O15511 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARPC5O15511 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC5O15511 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC5O15511 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARPC5O15511 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC5O15511 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARPC5O15511 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARPC5O15511 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARPC5O15511 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARPC5O15511 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC5O15511 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC5O15511 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARPC5O15511 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARPC5O15511 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARPC5O15511 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARPC5O15511 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARPC5O15511 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms