Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHOX2AO14813 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHOX2AO14813 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2AO14813 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHOX2AO14813 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHOX2AO14813 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHOX2AO14813 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHOX2AO14813 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2AO14813 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2AO14813 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2AO14813 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2AO14813 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2AO14813 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2AO14813 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2AO14813 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2AO14813 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2AO14813 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2AO14813 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2AO14813 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2AO14813 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2AO14813 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2AO14813 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2AO14813 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2AO14813 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2AO14813 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2AO14813 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2AO14813 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2AO14813 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2AO14813 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2AO14813 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2AO14813 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHOX2AO14813 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2AO14813 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2AO14813 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHOX2AO14813 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2AO14813 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2AO14813 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2AO14813 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2AO14813 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2AO14813 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2AO14813 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2AO14813 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2AO14813 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHOX2AO14813 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHOX2AO14813 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2AO14813 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHOX2AO14813 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHOX2AO14813 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHOX2AO14813 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHOX2AO14813 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHOX2AO14813 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHOX2AO14813 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHOX2AO14813 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHOX2AO14813 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms