Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MYO1FO00160 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MYO1FO00160 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MYO1FO00160 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYO1FO00160 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYO1FO00160 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYO1FO00160 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYO1FO00160 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYO1FO00160 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYO1FO00160 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO1FO00160 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO1FO00160 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO1FO00160 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO1FO00160 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYO1FO00160 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYO1FO00160 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MYO1FO00160 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYO1FO00160 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYO1FO00160 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYO1FO00160 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYO1FO00160 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYO1FO00160 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYO1FO00160 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYO1FO00160 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYO1FO00160 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYO1FO00160 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYO1FO00160 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYO1FO00160 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
MYO1FO00160 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYO1FO00160 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYO1FO00160 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYO1FO00160 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYO1FO00160 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYO1FO00160 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MYO1FO00160 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYO1FO00160 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYO1FO00160 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYO1FO00160 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MYO1FO00160 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MYO1FO00160 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYO1FO00160 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYO1FO00160 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
MYO1FO00160 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYO1FO00160 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MYO1FO00160 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MYO1FO00160 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MYO1FO00160 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO1FO00160 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO1FO00160 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO1FO00160 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO1FO00160 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MYO1FO00160 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYO1FO00160 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYO1FO00160 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYO1FO00160 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYO1FO00160 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO1FO00160 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO1FO00160 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO1FO00160 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO1FO00160 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYO1FO00160 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYO1FO00160 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MYO1FO00160 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MYO1FO00160 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYO1FO00160 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYO1FO00160 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MYO1FO00160 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MYO1FO00160 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYO1FO00160 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO1FO00160 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO1FO00160 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MYO1FO00160 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYO1FO00160 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYO1FO00160 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MYO1FO00160 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO1FO00160 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MYO1FO00160 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MYO1FO00160 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MYO1FO00160 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1FO00160 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1FO00160 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1FO00160 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO1FO00160 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1FO00160 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms