Protein–RNA interactions for Protein: O00115

DNASE2, Deoxyribonuclease-2-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE2O00115 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNASE2O00115 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNASE2O00115 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNASE2O00115 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE2O00115 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE2O00115 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNASE2O00115 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNASE2O00115 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNASE2O00115 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNASE2O00115 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNASE2O00115 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNASE2O00115 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE2O00115 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNASE2O00115 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNASE2O00115 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNASE2O00115 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE2O00115 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNASE2O00115 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNASE2O00115 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNASE2O00115 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNASE2O00115 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE2O00115 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE2O00115 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms