Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA6CA6NDK9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GOLGA6CA6NDK9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA6CA6NDK9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GOLGA6CA6NDK9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA6CA6NDK9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GOLGA6CA6NDK9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GOLGA6CA6NDK9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GOLGA6CA6NDK9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GOLGA6CA6NDK9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GOLGA6CA6NDK9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GOLGA6CA6NDK9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GOLGA6CA6NDK9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GOLGA6CA6NDK9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GOLGA6CA6NDK9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GOLGA6CA6NDK9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GOLGA6CA6NDK9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GOLGA6CA6NDK9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GOLGA6CA6NDK9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GOLGA6CA6NDK9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GOLGA6CA6NDK9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GOLGA6CA6NDK9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GOLGA6CA6NDK9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GOLGA6CA6NDK9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GOLGA6CA6NDK9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GOLGA6CA6NDK9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GOLGA6CA6NDK9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOLGA6CA6NDK9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOLGA6CA6NDK9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6CA6NDK9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOLGA6CA6NDK9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOLGA6CA6NDK9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOLGA6CA6NDK9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOLGA6CA6NDK9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOLGA6CA6NDK9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GOLGA6CA6NDK9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA6CA6NDK9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOLGA6CA6NDK9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLGA6CA6NDK9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA6CA6NDK9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLGA6CA6NDK9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA6CA6NDK9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLGA6CA6NDK9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6CA6NDK9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLGA6CA6NDK9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOLGA6CA6NDK9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLGA6CA6NDK9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLGA6CA6NDK9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA6CA6NDK9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA6CA6NDK9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLGA6CA6NDK9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA6CA6NDK9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA6CA6NDK9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA6CA6NDK9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA6CA6NDK9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GOLGA6CA6NDK9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA6CA6NDK9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA6CA6NDK9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA6CA6NDK9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA6CA6NDK9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA6CA6NDK9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA6CA6NDK9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA6CA6NDK9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GOLGA6CA6NDK9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GOLGA6CA6NDK9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLGA6CA6NDK9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLGA6CA6NDK9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLGA6CA6NDK9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA6CA6NDK9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GOLGA6CA6NDK9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLGA6CA6NDK9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6CA6NDK9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6CA6NDK9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6CA6NDK9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6CA6NDK9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms