Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GV50

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GV50 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1B0GV50 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GV50 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GV50 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GV50 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GV50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GV50 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GV50 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GV50 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1B0GV50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GV50 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1B0GV50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms