Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GUJ8

PNMA8C, Paraneoplastic antigen-like protein 8C, humanhuman

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA8CA0A1B0GUJ8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA8CA0A1B0GUJ8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA8CA0A1B0GUJ8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA8CA0A1B0GUJ8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA8CA0A1B0GUJ8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA8CA0A1B0GUJ8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA8CA0A1B0GUJ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8CA0A1B0GUJ8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8CA0A1B0GUJ8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8CA0A1B0GUJ8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA8CA0A1B0GUJ8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA8CA0A1B0GUJ8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA8CA0A1B0GUJ8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA8CA0A1B0GUJ8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA8CA0A1B0GUJ8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA8CA0A1B0GUJ8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA8CA0A1B0GUJ8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA8CA0A1B0GUJ8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8CA0A1B0GUJ8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8CA0A1B0GUJ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8CA0A1B0GUJ8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8CA0A1B0GUJ8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA8CA0A1B0GUJ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8CA0A1B0GUJ8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8CA0A1B0GUJ8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA8CA0A1B0GUJ8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA8CA0A1B0GUJ8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA8CA0A1B0GUJ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8CA0A1B0GUJ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA8CA0A1B0GUJ8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA8CA0A1B0GUJ8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8CA0A1B0GUJ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8CA0A1B0GUJ8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA8CA0A1B0GUJ8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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