Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J237

TRAV8-2, T-cell receptor alpha variable 8-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-2A0A0B4J237 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAV8-2A0A0B4J237 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAV8-2A0A0B4J237 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV8-2A0A0B4J237 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAV8-2A0A0B4J237 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAV8-2A0A0B4J237 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAV8-2A0A0B4J237 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAV8-2A0A0B4J237 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAV8-2A0A0B4J237 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAV8-2A0A0B4J237 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAV8-2A0A0B4J237 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAV8-2A0A0B4J237 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAV8-2A0A0B4J237 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV8-2A0A0B4J237 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV8-2A0A0B4J237 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAV8-2A0A0B4J237 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV8-2A0A0B4J237 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV8-2A0A0B4J237 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV8-2A0A0B4J237 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV8-2A0A0B4J237 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV8-2A0A0B4J237 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV8-2A0A0B4J237 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV8-2A0A0B4J237 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV8-2A0A0B4J237 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAV8-2A0A0B4J237 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV8-2A0A0B4J237 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV8-2A0A0B4J237 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV8-2A0A0B4J237 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAV8-2A0A0B4J237 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV8-2A0A0B4J237 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV8-2A0A0B4J237 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV8-2A0A0B4J237 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAV8-2A0A0B4J237 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV8-2A0A0B4J237 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV8-2A0A0B4J237 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAV8-2A0A0B4J237 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV8-2A0A0B4J237 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAV8-2A0A0B4J237 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAV8-2A0A0B4J237 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAV8-2A0A0B4J237 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAV8-2A0A0B4J237 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAV8-2A0A0B4J237 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAV8-2A0A0B4J237 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAV8-2A0A0B4J237 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAV8-2A0A0B4J237 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAV8-2A0A0B4J237 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAV8-2A0A0B4J237 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAV8-2A0A0B4J237 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAV8-2A0A0B4J237 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAV8-2A0A0B4J237 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAV8-2A0A0B4J237 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAV8-2A0A0B4J237 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAV8-2A0A0B4J237 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms