Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J237

TRAV8-2, T-cell receptor alpha variable 8-2 (Fragment), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-2A0A0B4J237 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAV8-2A0A0B4J237 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAV8-2A0A0B4J237 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAV8-2A0A0B4J237 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAV8-2A0A0B4J237 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAV8-2A0A0B4J237 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAV8-2A0A0B4J237 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAV8-2A0A0B4J237 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAV8-2A0A0B4J237 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAV8-2A0A0B4J237 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAV8-2A0A0B4J237 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAV8-2A0A0B4J237 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAV8-2A0A0B4J237 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAV8-2A0A0B4J237 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAV8-2A0A0B4J237 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAV8-2A0A0B4J237 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAV8-2A0A0B4J237 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAV8-2A0A0B4J237 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAV8-2A0A0B4J237 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAV8-2A0A0B4J237 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAV8-2A0A0B4J237 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAV8-2A0A0B4J237 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAV8-2A0A0B4J237 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAV8-2A0A0B4J237 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV8-2A0A0B4J237 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV8-2A0A0B4J237 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAV8-2A0A0B4J237 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAV8-2A0A0B4J237 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAV8-2A0A0B4J237 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV8-2A0A0B4J237 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV8-2A0A0B4J237 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAV8-2A0A0B4J237 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV8-2A0A0B4J237 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV8-2A0A0B4J237 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAV8-2A0A0B4J237 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAV8-2A0A0B4J237 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAV8-2A0A0B4J237 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAV8-2A0A0B4J237 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAV8-2A0A0B4J237 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAV8-2A0A0B4J237 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAV8-2A0A0B4J237 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAV8-2A0A0B4J237 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV8-2A0A0B4J237 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV8-2A0A0B4J237 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV8-2A0A0B4J237 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV8-2A0A0B4J237 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV8-2A0A0B4J237 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV8-2A0A0B4J237 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV8-2A0A0B4J237 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV8-2A0A0B4J237 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV8-2A0A0B4J237 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV8-2A0A0B4J237 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAV8-2A0A0B4J237 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAV8-2A0A0B4J237 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAV8-2A0A0B4J237 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAV8-2A0A0B4J237 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV8-2A0A0B4J237 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV8-2A0A0B4J237 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV8-2A0A0B4J237 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV8-2A0A0B4J237 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV8-2A0A0B4J237 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV8-2A0A0B4J237 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV8-2A0A0B4J237 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV8-2A0A0B4J237 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV8-2A0A0B4J237 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV8-2A0A0B4J237 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV8-2A0A0B4J237 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV8-2A0A0B4J237 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV8-2A0A0B4J237 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV8-2A0A0B4J237 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV8-2A0A0B4J237 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV8-2A0A0B4J237 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV8-2A0A0B4J237 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV8-2A0A0B4J237 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV8-2A0A0B4J237 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV8-2A0A0B4J237 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV8-2A0A0B4J237 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV8-2A0A0B4J237 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV8-2A0A0B4J237 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV8-2A0A0B4J237 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV8-2A0A0B4J237 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV8-2A0A0B4J237 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV8-2A0A0B4J237 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV8-2A0A0B4J237 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV8-2A0A0B4J237 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV8-2A0A0B4J237 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV8-2A0A0B4J237 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV8-2A0A0B4J237 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV8-2A0A0B4J237 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV8-2A0A0B4J237 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAV8-2A0A0B4J237 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAV8-2A0A0B4J237 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV8-2A0A0B4J237 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAV8-2A0A0B4J237 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV8-2A0A0B4J237 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAV8-2A0A0B4J237 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAV8-2A0A0B4J237 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAV8-2A0A0B4J237 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAV8-2A0A0B4J237 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAV8-2A0A0B4J237 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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