Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD4P55036 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD4P55036 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD4P55036 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD4P55036 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms