RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373461.8

VSTM2L-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM2L, Length 1,959 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2L-202ENST00000373461 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.65■■■■■ 6.66
VSTM2L-202ENST00000373461 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.67■■■■■ 5.54
VSTM2L-202ENST00000373461 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
VSTM2L-202ENST00000373461 ABCC9O60706 1549 aa47.29■■■■■ 5.16
VSTM2L-202ENST00000373461 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.89■■■■■ 5.1
VSTM2L-202ENST00000373461 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.84■■■■■ 5.09
VSTM2L-202ENST00000373461 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.53■■■■■ 5.04
VSTM2L-202ENST00000373461 NACADO15069 1562 aa46.36■■■■■ 5.01
VSTM2L-202ENST00000373461 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.06■■■■■ 4.96
VSTM2L-202ENST00000373461 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.75■■■■■ 4.91
VSTM2L-202ENST00000373461 SCRIBQ14160 1630 aa45.53■■■■■ 4.88
VSTM2L-202ENST00000373461 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.13■■■■■ 4.82
VSTM2L-202ENST00000373461 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.66■■■■■ 4.74
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VSTM2L-202ENST00000373461 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.01■■■■■ 4.64
VSTM2L-202ENST00000373461 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
VSTM2L-202ENST00000373461 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
VSTM2L-202ENST00000373461 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
VSTM2L-202ENST00000373461 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.72■■■■■ 4.59
VSTM2L-202ENST00000373461 SMARCA4P51532 1647 aa43.65■■■■■ 4.58
VSTM2L-202ENST00000373461 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
VSTM2L-202ENST00000373461 WIZO95785 1651 aa43.34■■■■■ 4.53
VSTM2L-202ENST00000373461 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.18■■■■■ 4.5
VSTM2L-202ENST00000373461 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.04■■■■■ 4.48
VSTM2L-202ENST00000373461 SMARCA2P51531 1590 aa43.03■■■■■ 4.48
VSTM2L-202ENST00000373461 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
VSTM2L-202ENST00000373461 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.83■■■■■ 4.45
VSTM2L-202ENST00000373461 NCAPD3P42695 1498 aa42.77■■■■■ 4.44
VSTM2L-202ENST00000373461 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
VSTM2L-202ENST00000373461 HMGXB3Q12766 1538 aa42.68■■■■■ 4.42
VSTM2L-202ENST00000373461 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.43■■■■■ 4.38
VSTM2L-202ENST00000373461 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.12■■■■■ 4.33
VSTM2L-202ENST00000373461 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.72■■■■■ 4.27
VSTM2L-202ENST00000373461 CFTRP13569 1480 aa41.69■■■■■ 4.26
VSTM2L-202ENST00000373461 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.62■■■■■ 4.25
VSTM2L-202ENST00000373461 PRDM2Q13029 1718 aa41.5■■■■■ 4.23
VSTM2L-202ENST00000373461 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.41■■■■■ 4.22
VSTM2L-202ENST00000373461 NESP48681 1621 aa41.37■■■■■ 4.21
VSTM2L-202ENST00000373461 ABCC8Q09428 1581 aa41.37■■■■■ 4.21
VSTM2L-202ENST00000373461 TRIM41Q8WV44 630 aa41.27■■■■■ 4.2
VSTM2L-202ENST00000373461 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
VSTM2L-202ENST00000373461 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.15■■■■■ 4.18
VSTM2L-202ENST00000373461 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.08■■■■■ 4.17
VSTM2L-202ENST00000373461 SYNJ1O43426 1573 aa41.03■■■■■ 4.16
VSTM2L-202ENST00000373461 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.95■■■■■ 4.15
VSTM2L-202ENST00000373461 TOP2BQ02880 1626 aa40.94■■■■■ 4.14
VSTM2L-202ENST00000373461 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.92■■■■■ 4.14
VSTM2L-202ENST00000373461 CUX1P39880 1505 aa40.91■■■■■ 4.14
VSTM2L-202ENST00000373461 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.91■■■■■ 4.14
VSTM2L-202ENST00000373461 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.72■■■■■ 4.11
VSTM2L-202ENST00000373461 TOPBP1Q92547 1522 aa40.66■■■■■ 4.1
VSTM2L-202ENST00000373461 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
VSTM2L-202ENST00000373461 ERCC6Q03468 1493 aa40.61■■■■■ 4.09
VSTM2L-202ENST00000373461 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.57■■■■■ 4.08
VSTM2L-202ENST00000373461 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.54■■■■■ 4.08
VSTM2L-202ENST00000373461 SOGA1O94964 1423 aa40.49■■■■■ 4.07
VSTM2L-202ENST00000373461 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
VSTM2L-202ENST00000373461 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
VSTM2L-202ENST00000373461 WDR62O43379 1518 aa40.4■■■■■ 4.06
VSTM2L-202ENST00000373461 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
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VSTM2L-202ENST00000373461 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.36■■■■■ 4.05
VSTM2L-202ENST00000373461 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.26■■■■■ 4.03
VSTM2L-202ENST00000373461 KIF27Q86VH2 1401 aa40.2■■■■■ 4.03
VSTM2L-202ENST00000373461 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.2■■■■■ 4.03
VSTM2L-202ENST00000373461 CUX2O14529 1486 aa40.18■■■■■ 4.02
VSTM2L-202ENST00000373461 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.16■■■■■ 4.02
VSTM2L-202ENST00000373461 WDR97A6NE52 1622 aa40.13■■■■■ 4.01
VSTM2L-202ENST00000373461 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
VSTM2L-202ENST00000373461 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.06■■■■■ 4
VSTM2L-202ENST00000373461 IFT140Q96RY7 1462 aa40.01■■■■■ 4
VSTM2L-202ENST00000373461 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.92■■■■□ 3.98
VSTM2L-202ENST00000373461 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
VSTM2L-202ENST00000373461 IGF1RP08069 1367 aa39.88■■■■□ 3.97
VSTM2L-202ENST00000373461 KIF21BO75037 1637 aa39.87■■■■□ 3.97
VSTM2L-202ENST00000373461 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.84■■■■□ 3.97
VSTM2L-202ENST00000373461 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.83■■■■□ 3.97
VSTM2L-202ENST00000373461 PRXQ9BXM0 1461 aa39.81■■■■□ 3.96
VSTM2L-202ENST00000373461 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
VSTM2L-202ENST00000373461 GOLGA3Q08378 1498 aa39.77■■■■□ 3.96
VSTM2L-202ENST00000373461 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.74■■■■□ 3.95
VSTM2L-202ENST00000373461 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.74■■■■□ 3.95
VSTM2L-202ENST00000373461 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.7■■■■□ 3.95
VSTM2L-202ENST00000373461 PBRM1Q86U86 1689 aa39.68■■■■□ 3.94
VSTM2L-202ENST00000373461 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.67■■■■□ 3.94
VSTM2L-202ENST00000373461 CUL7Q14999 1698 aa39.66■■■■□ 3.94
VSTM2L-202ENST00000373461 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
VSTM2L-202ENST00000373461 GRIN2BQ13224 1484 aa39.6■■■■□ 3.93
VSTM2L-202ENST00000373461 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
VSTM2L-202ENST00000373461 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.55■■■■□ 3.92
VSTM2L-202ENST00000373461 ADAMTS12P58397 1594 aa39.42■■■■□ 3.9
VSTM2L-202ENST00000373461 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.41■■■■□ 3.9
VSTM2L-202ENST00000373461 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.37■■■■□ 3.89
VSTM2L-202ENST00000373461 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
VSTM2L-202ENST00000373461 CEP162Q5TB80 1403 aa39.28■■■■□ 3.88
VSTM2L-202ENST00000373461 SYNJ2O15056 1496 aa39.19■■■■□ 3.86
VSTM2L-202ENST00000373461 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.15■■■■□ 3.86
VSTM2L-202ENST00000373461 GRIN2AQ12879 1464 aa39.12■■■■□ 3.85
VSTM2L-202ENST00000373461 CLIP1P30622 1438 aa39.1■■■■□ 3.85
VSTM2L-202ENST00000373461 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
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