Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHKAP35790 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHKAP35790 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHKAP35790 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKAP35790 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKAP35790 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKAP35790 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKAP35790 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKAP35790 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKAP35790 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKAP35790 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHKAP35790 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHKAP35790 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHKAP35790 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHKAP35790 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHKAP35790 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHKAP35790 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHKAP35790 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHKAP35790 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHKAP35790 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHKAP35790 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHKAP35790 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHKAP35790 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHKAP35790 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHKAP35790 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHKAP35790 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHKAP35790 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHKAP35790 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKAP35790 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKAP35790 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKAP35790 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKAP35790 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKAP35790 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKAP35790 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKAP35790 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKAP35790 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKAP35790 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKAP35790 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKAP35790 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKAP35790 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKAP35790 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKAP35790 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKAP35790 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKAP35790 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKAP35790 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKAP35790 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHKAP35790 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHKAP35790 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHKAP35790 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHKAP35790 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHKAP35790 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKAP35790 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKAP35790 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKAP35790 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKAP35790 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKAP35790 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKAP35790 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKAP35790 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKAP35790 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKAP35790 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKAP35790 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKAP35790 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKAP35790 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKAP35790 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHKAP35790 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHKAP35790 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHKAP35790 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKAP35790 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKAP35790 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKAP35790 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKAP35790 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKAP35790 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKAP35790 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKAP35790 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKAP35790 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKAP35790 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKAP35790 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKAP35790 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKAP35790 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKAP35790 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKAP35790 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKAP35790 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHKAP35790 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKAP35790 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKAP35790 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKAP35790 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKAP35790 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKAP35790 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKAP35790 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKAP35790 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKAP35790 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms