Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KB2Q9UBS0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB2Q9UBS0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KB2Q9UBS0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms