Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RPS6KB2Q9UBS0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RPS6KB2Q9UBS0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RPS6KB2Q9UBS0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RPS6KB2Q9UBS0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RPS6KB2Q9UBS0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KB2Q9UBS0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPS6KB2Q9UBS0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPS6KB2Q9UBS0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPS6KB2Q9UBS0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPS6KB2Q9UBS0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPS6KB2Q9UBS0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPS6KB2Q9UBS0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPS6KB2Q9UBS0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPS6KB2Q9UBS0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPS6KB2Q9UBS0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB2Q9UBS0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KB2Q9UBS0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6KB2Q9UBS0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KB2Q9UBS0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KB2Q9UBS0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPS6KB2Q9UBS0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KB2Q9UBS0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KB2Q9UBS0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KB2Q9UBS0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KB2Q9UBS0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KB2Q9UBS0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KB2Q9UBS0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB2Q9UBS0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KB2Q9UBS0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KB2Q9UBS0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KB2Q9UBS0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KB2Q9UBS0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KB2Q9UBS0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPS6KB2Q9UBS0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB2Q9UBS0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KB2Q9UBS0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KB2Q9UBS0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KB2Q9UBS0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KB2Q9UBS0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KB2Q9UBS0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KB2Q9UBS0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KB2Q9UBS0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KB2Q9UBS0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KB2Q9UBS0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RPS6KB2Q9UBS0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KB2Q9UBS0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KB2Q9UBS0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB2Q9UBS0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB2Q9UBS0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KB2Q9UBS0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KB2Q9UBS0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPS6KB2Q9UBS0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KB2Q9UBS0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KB2Q9UBS0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KB2Q9UBS0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KB2Q9UBS0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KB2Q9UBS0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KB2Q9UBS0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KB2Q9UBS0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KB2Q9UBS0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KB2Q9UBS0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB2Q9UBS0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB2Q9UBS0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KB2Q9UBS0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB2Q9UBS0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KB2Q9UBS0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KB2Q9UBS0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB2Q9UBS0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KB2Q9UBS0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KB2Q9UBS0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB2Q9UBS0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB2Q9UBS0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KB2Q9UBS0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB2Q9UBS0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KB2Q9UBS0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB2Q9UBS0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KB2Q9UBS0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KB2Q9UBS0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB2Q9UBS0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KB2Q9UBS0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KB2Q9UBS0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KB2Q9UBS0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KB2Q9UBS0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KB2Q9UBS0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KB2Q9UBS0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KB2Q9UBS0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KB2Q9UBS0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KB2Q9UBS0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KB2Q9UBS0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB2Q9UBS0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB2Q9UBS0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB2Q9UBS0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB2Q9UBS0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms