Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLS1Q14651 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLS1Q14651 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLS1Q14651 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLS1Q14651 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLS1Q14651 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLS1Q14651 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLS1Q14651 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLS1Q14651 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLS1Q14651 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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