Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PLS1Q14651 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PLS1Q14651 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PLS1Q14651 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PLS1Q14651 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PLS1Q14651 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PLS1Q14651 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PLS1Q14651 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PLS1Q14651 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PLS1Q14651 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PLS1Q14651 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLS1Q14651 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PLS1Q14651 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PLS1Q14651 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PLS1Q14651 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PLS1Q14651 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PLS1Q14651 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLS1Q14651 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PLS1Q14651 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PLS1Q14651 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PLS1Q14651 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PLS1Q14651 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PLS1Q14651 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PLS1Q14651 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLS1Q14651 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLS1Q14651 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PLS1Q14651 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PLS1Q14651 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PLS1Q14651 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PLS1Q14651 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PLS1Q14651 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PLS1Q14651 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PLS1Q14651 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PLS1Q14651 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PLS1Q14651 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PLS1Q14651 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PLS1Q14651 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PLS1Q14651 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PLS1Q14651 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PLS1Q14651 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PLS1Q14651 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PLS1Q14651 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PLS1Q14651 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PLS1Q14651 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PLS1Q14651 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PLS1Q14651 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PLS1Q14651 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLS1Q14651 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PLS1Q14651 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PLS1Q14651 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PLS1Q14651 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PLS1Q14651 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PLS1Q14651 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PLS1Q14651 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PLS1Q14651 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PLS1Q14651 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PLS1Q14651 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PLS1Q14651 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PLS1Q14651 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PLS1Q14651 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PLS1Q14651 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PLS1Q14651 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PLS1Q14651 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PLS1Q14651 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PLS1Q14651 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PLS1Q14651 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PLS1Q14651 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PLS1Q14651 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PLS1Q14651 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PLS1Q14651 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PLS1Q14651 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PLS1Q14651 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PLS1Q14651 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PLS1Q14651 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PLS1Q14651 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PLS1Q14651 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PLS1Q14651 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PLS1Q14651 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PLS1Q14651 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PLS1Q14651 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PLS1Q14651 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PLS1Q14651 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PLS1Q14651 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PLS1Q14651 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLS1Q14651 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLS1Q14651 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLS1Q14651 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLS1Q14651 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLS1Q14651 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLS1Q14651 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PLS1Q14651 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLS1Q14651 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLS1Q14651 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLS1Q14651 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PLS1Q14651 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PLS1Q14651 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PLS1Q14651 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLS1Q14651 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PLS1Q14651 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLS1Q14651 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms