RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583311.1

MIR3960-201, Transcript of microRNA 3960, humanhuman

BASIC

Gene MIR3960, Length 91 nt, Biotype miRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3960-201ENST00000583311 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.73■■■■■ 6.99
MIR3960-201ENST00000583311 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.12■■■■■ 5.93
MIR3960-201ENST00000583311 ABCC9O60706 1549 aa50.62■■■■■ 5.69
MIR3960-201ENST00000583311 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
MIR3960-201ENST00000583311 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.96■■■■■ 5.43
MIR3960-201ENST00000583311 NACADO15069 1562 aa48.94■■■■■ 5.42
MIR3960-201ENST00000583311 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.91■■■■■ 5.42
MIR3960-201ENST00000583311 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.76■■■■■ 5.4
MIR3960-201ENST00000583311 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.66■■■■■ 5.38
MIR3960-201ENST00000583311 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.7■■■■■ 5.23
MIR3960-201ENST00000583311 SCRIBQ14160 1630 aa47.52■■■■■ 5.2
MIR3960-201ENST00000583311 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.34■■■■■ 5.17
MIR3960-201ENST00000583311 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.32■■■■■ 5.17
MIR3960-201ENST00000583311 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47■■■■■ 5.11
MIR3960-201ENST00000583311 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
MIR3960-201ENST00000583311 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.08■■■■■ 4.97
MIR3960-201ENST00000583311 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.81■■■■■ 4.92
MIR3960-201ENST00000583311 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.65■■■■■ 4.9
MIR3960-201ENST00000583311 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
MIR3960-201ENST00000583311 SMARCA4P51532 1647 aa45.51■■■■■ 4.88
MIR3960-201ENST00000583311 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.23■■■■■ 4.83
MIR3960-201ENST00000583311 SMARCA2P51531 1590 aa45.2■■■■■ 4.83
MIR3960-201ENST00000583311 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.17■■■■■ 4.82
MIR3960-201ENST00000583311 NCAPD3P42695 1498 aa45.12■■■■■ 4.81
MIR3960-201ENST00000583311 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.07■■■■■ 4.81
MIR3960-201ENST00000583311 HMGXB3Q12766 1538 aa44.95■■■■■ 4.79
MIR3960-201ENST00000583311 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
MIR3960-201ENST00000583311 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
MIR3960-201ENST00000583311 WIZO95785 1651 aa44.76■■■■■ 4.76
MIR3960-201ENST00000583311 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
MIR3960-201ENST00000583311 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
MIR3960-201ENST00000583311 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.92■■■■■ 4.62
MIR3960-201ENST00000583311 NESP48681 1621 aa43.86■■■■■ 4.61
MIR3960-201ENST00000583311 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.83■■■■■ 4.61
MIR3960-201ENST00000583311 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.81■■■■■ 4.6
MIR3960-201ENST00000583311 ERCC6Q03468 1493 aa43.69■■■■■ 4.58
MIR3960-201ENST00000583311 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.63■■■■■ 4.57
MIR3960-201ENST00000583311 CFTRP13569 1480 aa43.63■■■■■ 4.57
MIR3960-201ENST00000583311 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.39■■■■■ 4.54
MIR3960-201ENST00000583311 PRDM2Q13029 1718 aa43.34■■■■■ 4.53
MIR3960-201ENST00000583311 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.32■■■■■ 4.53
MIR3960-201ENST00000583311 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.26■■■■■ 4.52
MIR3960-201ENST00000583311 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
MIR3960-201ENST00000583311 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.13■■■■■ 4.49
MIR3960-201ENST00000583311 CUX2O14529 1486 aa43.11■■■■■ 4.49
MIR3960-201ENST00000583311 WDR62O43379 1518 aa42.96■■■■■ 4.47
MIR3960-201ENST00000583311 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
MIR3960-201ENST00000583311 ABCC8Q09428 1581 aa42.77■■■■■ 4.44
MIR3960-201ENST00000583311 TOPBP1Q92547 1522 aa42.66■■■■■ 4.42
MIR3960-201ENST00000583311 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.65■■■■■ 4.42
MIR3960-201ENST00000583311 CUX1P39880 1505 aa42.42■■■■■ 4.38
MIR3960-201ENST00000583311 IFT140Q96RY7 1462 aa42.35■■■■■ 4.37
MIR3960-201ENST00000583311 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.33■■■■■ 4.37
MIR3960-201ENST00000583311 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
MIR3960-201ENST00000583311 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.26■■■■■ 4.36
MIR3960-201ENST00000583311 TOP2BQ02880 1626 aa42.19■■■■■ 4.34
MIR3960-201ENST00000583311 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.17■■■■■ 4.34
MIR3960-201ENST00000583311 SOGA1O94964 1423 aa42.17■■■■■ 4.34
MIR3960-201ENST00000583311 SYNJ1O43426 1573 aa42.14■■■■■ 4.34
MIR3960-201ENST00000583311 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
MIR3960-201ENST00000583311 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.09■■■■■ 4.33
MIR3960-201ENST00000583311 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
MIR3960-201ENST00000583311 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
MIR3960-201ENST00000583311 WDR97A6NE52 1622 aa41.94■■■■■ 4.3
MIR3960-201ENST00000583311 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.89■■■■■ 4.3
MIR3960-201ENST00000583311 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
MIR3960-201ENST00000583311 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
MIR3960-201ENST00000583311 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.69■■■■■ 4.26
MIR3960-201ENST00000583311 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.66■■■■■ 4.26
MIR3960-201ENST00000583311 GRIN2BQ13224 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
MIR3960-201ENST00000583311 TRIM41Q8WV44 630 aa41.57■■■■■ 4.25
MIR3960-201ENST00000583311 PBRM1Q86U86 1689 aa41.56■■■■■ 4.24
MIR3960-201ENST00000583311 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
MIR3960-201ENST00000583311 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.52■■■■■ 4.24
MIR3960-201ENST00000583311 KIF27Q86VH2 1401 aa41.45■■■■■ 4.23
MIR3960-201ENST00000583311 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.41■■■■■ 4.22
MIR3960-201ENST00000583311 OSCARQ8IYS5 282 aa41.37■■■■■ 4.21
MIR3960-201ENST00000583311 FBLN2P98095 1184 aa41.35■■■■■ 4.21
MIR3960-201ENST00000583311 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.35■■■■■ 4.21
MIR3960-201ENST00000583311 SYNJ2O15056 1496 aa41.34■■■■■ 4.21
MIR3960-201ENST00000583311 CHD1O14646 1710 aa41.32■■■■■ 4.21
MIR3960-201ENST00000583311 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
MIR3960-201ENST00000583311 ADAMTS12P58397 1594 aa41.25■■■■■ 4.19
MIR3960-201ENST00000583311 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.24■■■■■ 4.19
MIR3960-201ENST00000583311 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.2■■■■■ 4.19
MIR3960-201ENST00000583311 IGF1RP08069 1367 aa41.17■■■■■ 4.18
MIR3960-201ENST00000583311 CUL7Q14999 1698 aa41.11■■■■■ 4.17
MIR3960-201ENST00000583311 GRIN2AQ12879 1464 aa41.1■■■■■ 4.17
MIR3960-201ENST00000583311 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.03■■■■■ 4.16
MIR3960-201ENST00000583311 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.98■■■■■ 4.15
MIR3960-201ENST00000583311 EEA1Q15075 1411 aa40.91■■■■■ 4.14
MIR3960-201ENST00000583311 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.9■■■■■ 4.14
MIR3960-201ENST00000583311 NUP160Q12769 1436 aa40.89■■■■■ 4.14
MIR3960-201ENST00000583311 CEP170Q5SW79 1584 aa40.84■■■■■ 4.13
MIR3960-201ENST00000583311 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.78■■■■■ 4.12
MIR3960-201ENST00000583311 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.75■■■■■ 4.11
MIR3960-201ENST00000583311 PRXQ9BXM0 1461 aa40.68■■■■■ 4.1
MIR3960-201ENST00000583311 ARHGEF11O15085 1522 aa40.66■■■■■ 4.1
MIR3960-201ENST00000583311 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
MIR3960-201ENST00000583311 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms