Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNEQ04844 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNEQ04844 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms