Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXP28300 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXP28300 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXP28300 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXP28300 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXP28300 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXP28300 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LOXP28300 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LOXP28300 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXP28300 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXP28300 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXP28300 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXP28300 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXP28300 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXP28300 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXP28300 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXP28300 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXP28300 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXP28300 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXP28300 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXP28300 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXP28300 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXP28300 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXP28300 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXP28300 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXP28300 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXP28300 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXP28300 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXP28300 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXP28300 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXP28300 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXP28300 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXP28300 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXP28300 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXP28300 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXP28300 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXP28300 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXP28300 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXP28300 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXP28300 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXP28300 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXP28300 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXP28300 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXP28300 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXP28300 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXP28300 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LOXP28300 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXP28300 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXP28300 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXP28300 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXP28300 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXP28300 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXP28300 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXP28300 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXP28300 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXP28300 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXP28300 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXP28300 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXP28300 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXP28300 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXP28300 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXP28300 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXP28300 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXP28300 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXP28300 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXP28300 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LOXP28300 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXP28300 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXP28300 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXP28300 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXP28300 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXP28300 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXP28300 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LOXP28300 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LOXP28300 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LOXP28300 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LOXP28300 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LOXP28300 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LOXP28300 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LOXP28300 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LOXP28300 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXP28300 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXP28300 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXP28300 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXP28300 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXP28300 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXP28300 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXP28300 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXP28300 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXP28300 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXP28300 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXP28300 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms