Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L1O43166 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIPA1L1O43166 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIPA1L1O43166 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIPA1L1O43166 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SIPA1L1O43166 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms