RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613760.4

WDR38-202, Transcript of WD repeat domain 38, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR38, Length 1,323 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38-202ENST00000613760 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.16■■■■■ 6.9
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WDR38-202ENST00000613760 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.29■■■■■ 5.32
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WDR38-202ENST00000613760 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.17■■■■■ 5.3
WDR38-202ENST00000613760 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.17■■■■■ 5.3
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WDR38-202ENST00000613760 SCRIBQ14160 1630 aa47.11■■■■■ 5.13
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WDR38-202ENST00000613760 SMARCA4P51532 1647 aa45.11■■■■■ 4.81
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WDR38-202ENST00000613760 SMARCA2P51531 1590 aa44.65■■■■■ 4.74
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WDR38-202ENST00000613760 NCAPD3P42695 1498 aa44.48■■■■■ 4.71
WDR38-202ENST00000613760 WIZO95785 1651 aa44.48■■■■■ 4.71
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WDR38-202ENST00000613760 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.18■■■■■ 4.5
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WDR38-202ENST00000613760 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.03■■■■■ 4.48
WDR38-202ENST00000613760 ERCC6Q03468 1493 aa42.95■■■■■ 4.47
WDR38-202ENST00000613760 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.91■■■■■ 4.46
WDR38-202ENST00000613760 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.76■■■■■ 4.44
WDR38-202ENST00000613760 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
WDR38-202ENST00000613760 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.7■■■■■ 4.43
WDR38-202ENST00000613760 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.52■■■■■ 4.4
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WDR38-202ENST00000613760 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.22■■■■■ 4.35
WDR38-202ENST00000613760 TOPBP1Q92547 1522 aa42.16■■■■■ 4.34
WDR38-202ENST00000613760 ABCC8Q09428 1581 aa42.16■■■■■ 4.34
WDR38-202ENST00000613760 CUX1P39880 1505 aa42.05■■■■■ 4.32
WDR38-202ENST00000613760 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.94■■■■■ 4.3
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WDR38-202ENST00000613760 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
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WDR38-202ENST00000613760 GRIN2BQ13224 1484 aa41.1■■■■■ 4.17
WDR38-202ENST00000613760 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.01■■■■■ 4.16
WDR38-202ENST00000613760 CHD1O14646 1710 aa40.97■■■■■ 4.15
WDR38-202ENST00000613760 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.97■■■■■ 4.15
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WDR38-202ENST00000613760 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.29■■■■■ 4.04
WDR38-202ENST00000613760 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.28■■■■■ 4.04
WDR38-202ENST00000613760 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
WDR38-202ENST00000613760 KIF21BO75037 1637 aa40.21■■■■■ 4.03
WDR38-202ENST00000613760 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.21■■■■■ 4.03
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