Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACKR4Q9NPB9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR4Q9NPB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR4Q9NPB9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR4Q9NPB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms