Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDFQ9HBH1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDFQ9HBH1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDFQ9HBH1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms