Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRP36Q96EU6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP36Q96EU6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP36Q96EU6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RRP36Q96EU6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RRP36Q96EU6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP36Q96EU6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
RRP36Q96EU6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP36Q96EU6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP36Q96EU6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP36Q96EU6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms