Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT9Q92600 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT9Q92600 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT9Q92600 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT9Q92600 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT9Q92600 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT9Q92600 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms