Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POU5F1Q01860 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POU5F1Q01860 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POU5F1Q01860 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POU5F1Q01860 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POU5F1Q01860 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POU5F1Q01860 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POU5F1Q01860 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POU5F1Q01860 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POU5F1Q01860 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POU5F1Q01860 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms