Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB38P57729 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB38P57729 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB38P57729 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB38P57729 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB38P57729 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB38P57729 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB38P57729 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB38P57729 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB38P57729 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB38P57729 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB38P57729 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB38P57729 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB38P57729 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB38P57729 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB38P57729 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB38P57729 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB38P57729 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB38P57729 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB38P57729 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB38P57729 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB38P57729 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB38P57729 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB38P57729 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB38P57729 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB38P57729 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB38P57729 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB38P57729 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB38P57729 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB38P57729 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB38P57729 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB38P57729 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB38P57729 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB38P57729 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB38P57729 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB38P57729 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB38P57729 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB38P57729 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB38P57729 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB38P57729 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB38P57729 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB38P57729 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB38P57729 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB38P57729 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB38P57729 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB38P57729 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB38P57729 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB38P57729 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB38P57729 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB38P57729 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB38P57729 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB38P57729 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB38P57729 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB38P57729 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB38P57729 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB38P57729 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB38P57729 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB38P57729 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB38P57729 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB38P57729 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB38P57729 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB38P57729 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB38P57729 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB38P57729 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB38P57729 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB38P57729 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB38P57729 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB38P57729 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB38P57729 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB38P57729 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB38P57729 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB38P57729 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB38P57729 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB38P57729 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB38P57729 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB38P57729 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB38P57729 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB38P57729 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB38P57729 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB38P57729 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB38P57729 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB38P57729 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB38P57729 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB38P57729 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB38P57729 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB38P57729 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB38P57729 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB38P57729 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB38P57729 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB38P57729 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB38P57729 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB38P57729 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB38P57729 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB38P57729 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB38P57729 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB38P57729 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB38P57729 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB38P57729 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB38P57729 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB38P57729 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms