Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH8P55286 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH8P55286 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH8P55286 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH8P55286 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH8P55286 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH8P55286 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH8P55286 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH8P55286 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH8P55286 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDH8P55286 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDH8P55286 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH8P55286 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH8P55286 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH8P55286 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH8P55286 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH8P55286 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH8P55286 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH8P55286 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH8P55286 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH8P55286 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH8P55286 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH8P55286 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH8P55286 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH8P55286 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH8P55286 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH8P55286 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH8P55286 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH8P55286 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH8P55286 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH8P55286 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH8P55286 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH8P55286 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH8P55286 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH8P55286 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH8P55286 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH8P55286 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH8P55286 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH8P55286 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH8P55286 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH8P55286 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH8P55286 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH8P55286 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH8P55286 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH8P55286 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH8P55286 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH8P55286 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH8P55286 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH8P55286 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH8P55286 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH8P55286 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH8P55286 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH8P55286 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH8P55286 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH8P55286 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH8P55286 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH8P55286 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH8P55286 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH8P55286 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH8P55286 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH8P55286 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH8P55286 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH8P55286 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDH8P55286 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH8P55286 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH8P55286 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDH8P55286 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH8P55286 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH8P55286 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH8P55286 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDH8P55286 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH8P55286 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH8P55286 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH8P55286 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDH8P55286 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH8P55286 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH8P55286 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH8P55286 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDH8P55286 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH8P55286 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH8P55286 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDH8P55286 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH8P55286 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH8P55286 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH8P55286 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH8P55286 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH8P55286 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDH8P55286 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH8P55286 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH8P55286 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH8P55286 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDH8P55286 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH8P55286 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH8P55286 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH8P55286 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDH8P55286 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH8P55286 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDH8P55286 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH8P55286 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDH8P55286 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms