Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB28P51157 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB28P51157 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB28P51157 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB28P51157 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB28P51157 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB28P51157 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB28P51157 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB28P51157 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB28P51157 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB28P51157 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB28P51157 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB28P51157 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB28P51157 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB28P51157 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB28P51157 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB28P51157 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB28P51157 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB28P51157 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB28P51157 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB28P51157 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB28P51157 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB28P51157 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB28P51157 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB28P51157 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB28P51157 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB28P51157 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB28P51157 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB28P51157 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB28P51157 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB28P51157 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB28P51157 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB28P51157 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB28P51157 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB28P51157 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB28P51157 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB28P51157 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB28P51157 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB28P51157 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB28P51157 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB28P51157 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB28P51157 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB28P51157 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB28P51157 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB28P51157 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB28P51157 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB28P51157 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB28P51157 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB28P51157 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB28P51157 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB28P51157 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB28P51157 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB28P51157 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB28P51157 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB28P51157 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB28P51157 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB28P51157 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB28P51157 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB28P51157 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB28P51157 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB28P51157 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB28P51157 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB28P51157 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB28P51157 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB28P51157 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB28P51157 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB28P51157 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB28P51157 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB28P51157 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB28P51157 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB28P51157 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB28P51157 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB28P51157 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB28P51157 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB28P51157 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB28P51157 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB28P51157 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB28P51157 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB28P51157 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB28P51157 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB28P51157 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB28P51157 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB28P51157 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB28P51157 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB28P51157 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB28P51157 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB28P51157 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB28P51157 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB28P51157 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB28P51157 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB28P51157 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB28P51157 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB28P51157 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB28P51157 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB28P51157 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB28P51157 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB28P51157 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB28P51157 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB28P51157 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB28P51157 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms