Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAB28P51157 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAB28P51157 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB28P51157 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB28P51157 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RAB28P51157 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAB28P51157 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RAB28P51157 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RAB28P51157 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RAB28P51157 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB28P51157 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAB28P51157 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAB28P51157 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAB28P51157 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RAB28P51157 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAB28P51157 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB28P51157 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAB28P51157 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAB28P51157 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAB28P51157 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RAB28P51157 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RAB28P51157 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RAB28P51157 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB28P51157 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB28P51157 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAB28P51157 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RAB28P51157 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAB28P51157 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAB28P51157 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAB28P51157 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAB28P51157 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAB28P51157 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAB28P51157 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAB28P51157 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB28P51157 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB28P51157 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB28P51157 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB28P51157 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB28P51157 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB28P51157 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB28P51157 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB28P51157 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB28P51157 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAB28P51157 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB28P51157 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB28P51157 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB28P51157 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAB28P51157 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB28P51157 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB28P51157 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB28P51157 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB28P51157 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB28P51157 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB28P51157 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB28P51157 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB28P51157 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB28P51157 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB28P51157 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB28P51157 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB28P51157 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB28P51157 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB28P51157 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB28P51157 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB28P51157 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB28P51157 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB28P51157 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB28P51157 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB28P51157 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB28P51157 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB28P51157 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB28P51157 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB28P51157 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB28P51157 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB28P51157 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB28P51157 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB28P51157 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB28P51157 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB28P51157 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB28P51157 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB28P51157 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB28P51157 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB28P51157 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAB28P51157 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB28P51157 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB28P51157 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB28P51157 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB28P51157 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB28P51157 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB28P51157 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB28P51157 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB28P51157 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB28P51157 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB28P51157 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB28P51157 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB28P51157 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB28P51157 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB28P51157 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB28P51157 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB28P51157 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB28P51157 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms