Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ITGAEP38570 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ITGAEP38570 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ITGAEP38570 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
ITGAEP38570 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ITGAEP38570 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ITGAEP38570 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms