Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.23■■■■■ 5.95
ITGAEP38570 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
ITGAEP38570 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.65■■■■■ 5.7
ITGAEP38570 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.56■■■■■ 5.68
ITGAEP38570 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
ITGAEP38570 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
ITGAEP38570 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.42■■■■■ 5.66
ITGAEP38570 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.57■■■■■ 5.53
ITGAEP38570 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC49.34■■■■■ 5.49
ITGAEP38570 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
ITGAEP38570 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
ITGAEP38570 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
ITGAEP38570 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.67■■■■■ 5.38
ITGAEP38570 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC48.59■■■■■ 5.37
ITGAEP38570 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.55■■■■■ 5.36
ITGAEP38570 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.39■■■■■ 5.34
ITGAEP38570 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
ITGAEP38570 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.35■■■■■ 5.33
ITGAEP38570 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
ITGAEP38570 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.19■■■■■ 5.3
ITGAEP38570 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
ITGAEP38570 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
ITGAEP38570 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
ITGAEP38570 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
ITGAEP38570 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
ITGAEP38570 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
ITGAEP38570 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
ITGAEP38570 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
ITGAEP38570 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
ITGAEP38570 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
ITGAEP38570 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.85■■■■■ 5.09
ITGAEP38570 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
ITGAEP38570 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
ITGAEP38570 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
ITGAEP38570 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
ITGAEP38570 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
ITGAEP38570 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
ITGAEP38570 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
ITGAEP38570 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.44■■■■■ 5.02
ITGAEP38570 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
ITGAEP38570 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ITGAEP38570 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
ITGAEP38570 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
ITGAEP38570 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
ITGAEP38570 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
ITGAEP38570 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ITGAEP38570 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
ITGAEP38570 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
ITGAEP38570 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ITGAEP38570 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
ITGAEP38570 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
ITGAEP38570 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ITGAEP38570 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
ITGAEP38570 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
ITGAEP38570 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
ITGAEP38570 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
ITGAEP38570 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ITGAEP38570 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
ITGAEP38570 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ITGAEP38570 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
ITGAEP38570 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
ITGAEP38570 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
ITGAEP38570 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ITGAEP38570 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ITGAEP38570 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
ITGAEP38570 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ITGAEP38570 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ITGAEP38570 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ITGAEP38570 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ITGAEP38570 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
ITGAEP38570 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
ITGAEP38570 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.74
ITGAEP38570 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
ITGAEP38570 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ITGAEP38570 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ITGAEP38570 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ITGAEP38570 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ITGAEP38570 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ITGAEP38570 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
ITGAEP38570 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
ITGAEP38570 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
ITGAEP38570 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
ITGAEP38570 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
ITGAEP38570 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ITGAEP38570 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ITGAEP38570 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ITGAEP38570 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ITGAEP38570 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ITGAEP38570 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
ITGAEP38570 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
ITGAEP38570 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ITGAEP38570 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ITGAEP38570 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ITGAEP38570 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ITGAEP38570 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ITGAEP38570 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
ITGAEP38570 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ITGAEP38570 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ITGAEP38570 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
ITGAEP38570 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms