Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS4Y1P22090 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4Y1P22090 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4Y1P22090 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4Y1P22090 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4Y1P22090 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4Y1P22090 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS4Y1P22090 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS4Y1P22090 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4Y1P22090 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms