Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPSP04118 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPSP04118 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPSP04118 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPSP04118 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPSP04118 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLPSP04118 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPSP04118 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPSP04118 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPSP04118 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPSP04118 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPSP04118 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLPSP04118 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPSP04118 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPSP04118 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPSP04118 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPSP04118 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPSP04118 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPSP04118 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPSP04118 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLPSP04118 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPSP04118 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPSP04118 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPSP04118 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLPSP04118 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPSP04118 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLPSP04118 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPSP04118 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPSP04118 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPSP04118 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPSP04118 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPSP04118 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPSP04118 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPSP04118 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPSP04118 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPSP04118 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPSP04118 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPSP04118 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPSP04118 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPSP04118 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPSP04118 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPSP04118 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPSP04118 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPSP04118 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPSP04118 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPSP04118 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPSP04118 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPSP04118 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPSP04118 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPSP04118 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPSP04118 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPSP04118 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPSP04118 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPSP04118 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLPSP04118 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPSP04118 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPSP04118 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPSP04118 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPSP04118 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPSP04118 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPSP04118 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPSP04118 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPSP04118 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPSP04118 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPSP04118 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPSP04118 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPSP04118 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPSP04118 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPSP04118 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPSP04118 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPSP04118 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPSP04118 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPSP04118 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPSP04118 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPSP04118 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPSP04118 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPSP04118 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPSP04118 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPSP04118 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPSP04118 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPSP04118 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPSP04118 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPSP04118 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPSP04118 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPSP04118 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPSP04118 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPSP04118 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPSP04118 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPSP04118 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPSP04118 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPSP04118 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPSP04118 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms