Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXTL3O43909 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXTL3O43909 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXTL3O43909 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EXTL3O43909 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms