Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDELR3O43731 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDELR3O43731 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDELR3O43731 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDELR3O43731 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms