Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFIT3O14879 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFIT3O14879 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFIT3O14879 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IFIT3O14879 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IFIT3O14879 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms