Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YYE9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0J9YYE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0J9YYE9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms