Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COMMD8Q9NX08 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COMMD8Q9NX08 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COMMD8Q9NX08 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COMMD8Q9NX08 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COMMD8Q9NX08 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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