Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EHD4Q9H223 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EHD4Q9H223 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
EHD4Q9H223 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EHD4Q9H223 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EHD4Q9H223 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms