Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HHIPQ96QV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HHIPQ96QV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HHIPQ96QV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms